沒有意外，楊士聰遭到了群臣的抵制辱罵，在當時，火化相當于挫骨揚灰，誰愿意將自己的親人燒成灰？這簡直就是大逆不道！

    “死者為大，入土為安，楊士聰你枉讀圣賢書，竟想出如此違倫理道德之事，真是我輩讀書人的恥辱！”

    “對，其言可誅！”

    面對群臣呵斥辱罵，楊士聰硬著頭皮道：“鼠疫橫行，此間威力大家也看到了！嚴重性已經超越了孝道，當以大道之法，讓附身瘟疫回歸天地！”

    朝會爭吵熱烈，朱慈烺即時終止，就此作罷。

    第二日，楊士聰坐船自海上反還廣東，一回到廣東，他立即下令收集感染鼠疫而亡的疫尸千具，并將之集中在城外焚燒火化。

    聞訊的江南文人口誅筆伐，民情亦是洶洶，紛紛指責楊士聰喪盡天良，請奏太子將之誅殺，以平民憤！

    在漫天的奏本中，朱慈烺強行按下此事，并拖延了一個多月，最終功夫不負有心人，兩廣之地的疫情得到大大的緩解，死亡人數急速下降，感染之人也越來越少。

    當楊士聰再次出現在南京城時，上奏道：兩廣之地再無感染鼠疫之人，臣請天下效仿！

    都察院左都御史李邦華不信這個邪，決定親身前往廣東視察，揭穿此獠的真實面目，然而當他乘坐快船抵達廣州時，發現此地已經解除了封城封路，往來之人不斷。

    李邦華親身巡視了幾個地方，又微服私訪了一番，最終得出結論：楊士聰沒有說謊，廣東疫情真的退去了！

    李邦華當即上書，奏請各省效仿兩廣之法，焚燒病尸。

    不過他到底怕得罪天下讀書人，便在后面加了一條：請朝廷為火化者賜棺入土安葬。

    此事震動了整個江南之地，朱慈烺自然表示同意，又下令將患者接觸過的家具、用物等一并焚燒，損失由當地衙門補償......

    經過數月的宣傳，大量銀錢和糧食的投入，各地嚴厲的監控預防，江南各省疫情漸漸好轉，鼠疫得到了有效的控制，除長江沿岸各府縣，南方各省陸續解除封城封路。

    這一場防疫戰下來，朱慈烺數年之間囤積的糧草幾乎見底，加之北方鼠疫依舊泛濫，他不得不推遲大規模舉兵北上掃除流寇的計劃。