當(dāng)天，奉天殿內(nèi)舉行大朝會，當(dāng)庭正式宣布旨意，改組內(nèi)閣與軍機(jī)。

    旨意中明確表示，皇帝之下分為內(nèi)閣和軍機(jī)。

    內(nèi)閣辦公地點(diǎn)在紫禁城奉天殿東邊的文華殿，軍機(jī)辦公地點(diǎn)在奉天殿西邊的武英殿。

    住在文華殿的永王和定王二人，搬出紫禁城，朱慈烺將抄家所得的魏國公府和保國公府，分別賜給定王和永王，作為王府。

    內(nèi)閣大臣管理全國政務(wù)，治理國家促進(jìn)發(fā)展，掌管除軍隊(duì)和宗室外的一切國政事物。

    內(nèi)閣下屬吏部、戶部、禮部、工部、刑部、教化部、財政部（稅務(wù)部）、海事部、鴻臚寺（外交部）、翰林院。

    軍機(jī)大臣管理軍事，負(fù)責(zé)軍事作戰(zhàn)，開疆拓土。

    軍機(jī)控制全國的軍隊(duì)，掌軍令，可以對軍隊(duì)發(fā)號施令，對武官選拔、考核、升降、賞罰。

    軍機(jī)下屬兵部、情報部、后勤部、軍器部、贊畫部、軍工研究院、皇明軍校。

    其中兵部是軍屯部和五軍都督府的集合體，新的五軍都督府包括了軍屯職責(zé)，總部以前叫大都督府，朱慈烺將其直接改為兵部。

    軍機(jī)與內(nèi)閣的職權(quán)平等，凡軍機(jī)要務(wù)，內(nèi)閣無權(quán)過問。

    二者一文一武，互不通氣，分別向皇帝奏事，皇帝利用兩者之間的異同，直接控制軍權(quán)和政權(quán)。

    遇到戰(zhàn)事，皇帝召開御前會議，商量要不要打，打的話將要達(dá)到什么戰(zhàn)略目的，然后軍機(jī)去執(zhí)行，下達(dá)作戰(zhàn)命令。

    內(nèi)閣只負(fù)責(zé)調(diào)動各省的后勤支援，當(dāng)然了，各地都督府也會在當(dāng)?shù)卦O(shè)立后勤戰(zhàn)備倉儲，隨時應(yīng)對戰(zhàn)爭，避免文官們后勤不繼拖后腿，影響戰(zhàn)況。

    內(nèi)閣大臣和軍機(jī)大臣，皆由皇帝親自任免，主要以政績與軍功為依據(jù)。

    除了皇帝可以制約內(nèi)閣與軍機(jī)，朱慈烺又將都察院和軍法部獨(dú)立于內(nèi)閣與軍機(jī)外。

    都察院監(jiān)察文官，軍法部監(jiān)察武將，按章程辦事，形成制衡，聽命于皇帝。

    朱慈烺本想將財政權(quán)也單獨(dú)拿出來的，后來想想還是放棄了，財權(quán)要是拿出來，就是北宋的二府三司制了，容易造成冗官的現(xiàn)象，行政效率差。