而大明水師又是其中最嚴(yán)重的，一是兵種特色，需要艦隊(duì)和軍官相對(duì)穩(wěn)定，沒法像陸軍一樣可以定期調(diào)動(dòng)輪換。

二是巢湖水軍在大明軍隊(duì)的序列中，一直是很特殊的存在，保持著很高的獨(dú)立性。

這就是歷史遺留問題了。

在龍鳳元年之前，廖永安兄弟和俞廷玉父子組建的巢湖水師，實(shí)際上跟朱元璋的和州軍一樣，都是一支獨(dú)立反抗元朝的義師。

但在龍鳳元年，元朝二十萬(wàn)大軍圍困巢湖。巢湖水師承受了巨大的壓力，但依然拒絕接受招撫。

此時(shí)，廖永安等人聽說(shuō)朱元璋正在江北，而且麾下是一支戰(zhàn)無(wú)不勝、秋毫無(wú)犯的王者之師。便派俞通海突圍過(guò)江，表達(dá)投奔之意。

這時(shí)的朱元璋的義軍勢(shì)如破竹，他審時(shí)度勢(shì)，決定渡江謀取集慶路，也就是現(xiàn)在的南京，一舉奠定王霸之基。

但想要攻打集慶，就必經(jīng)過(guò)渡長(zhǎng)江，朱元璋正苦于沒有水師艦隊(duì)，在江北望而興嘆。聽說(shuō)巢湖水師要來(lái)歸順，樂得他一蹦三尺高，連喊數(shù)聲‘天助我也’！

因?yàn)槌埠畮煋碛猩锨覒?zhàn)船、近兩萬(wàn)部眾，數(shù)萬(wàn)石糧食、以及最寶貴的——眾多身經(jīng)百戰(zhàn)的水軍驍將，這些全都是朱元璋急缺的，他能不樂開了花？

于是朱元璋親率徐達(dá)等幾員大將來(lái)到巢湖，跟廖永安等人會(huì)盟，決定兩軍聯(lián)合，合作組成一支聯(lián)軍！

補(bǔ)齊最后一塊短板的朱元璋如虎添翼，一舉攻占集慶路，改名應(yīng)天，自此徹底成為有資格逐鹿天下的一方諸侯！

所以從一開始，雙方其實(shí)是聯(lián)盟來(lái)的。

用后世的話說(shuō)，就是人家是帶資入股的小股東，而不是像徐達(dá)這樣的高級(jí)打工人。

再加上巢湖水師確實(shí)拼命，廖永安、俞廷玉、俞通海等首領(lǐng)相繼為朱元璋的大業(yè)捐軀，是以朱元璋一直默許他們保持相對(duì)的獨(dú)立性。

不過(guò)那都是建國(guó)前的事情了。建國(guó)后，大明就只有一個(gè)老板，那就是朱老板了。

而且朱元璋相繼收編了方國(guó)珍、陳友定的水師，已經(jīng)不再像從前那么依賴巢湖水軍了。

偏生巢湖水軍那些有遠(yuǎn)見、約束力的頭領(lǐng)都已身故，新一代領(lǐng)袖廖永忠看不清形勢(shì)，依然想保留自己的獨(dú)立王國(guó)，不愿融合進(jìn)大明水師當(dāng)中。